細胞培養實驗室應能進行六方面的工作：無菌操作、孵育、制備、清洗、消毒自凈處理、儲藏。
1．無菌操作區
（1）無菌操作區：無菌操作區只限于細胞培養及其他無菌操作的區域，能與外界隔離，不能穿行或受其他干擾。
理想的無菌操作室應劃為三部分：
a) 更衣室—―供更換衣服、鞋子及穿戴帽子。
b) 緩沖間—―位于更衣間與操作間之間，目的是為了保證操作間的無菌環境，同時可放置恒溫培養箱及某些必需的小型儀器。
c) 無菌操作間—―于無菌操作、細胞培養。其大小要適當，且其頂部不宜過高（不超過2.5m）以保證紫外線的有效自凈效果；墻壁光滑*以便清潔和消毒。工作臺安置不應靠墻壁，臺面要光滑壓塑作表面，漆成白色或灰色以利于解剖組織及酚紅顯示pH的觀察。
（2）凈化工作臺：操作簡單，安裝方便，占用空間小且凈化效果很好。一般細菌培養室使用的凈化工作臺主要有兩種：a)側流式或稱垂直式 b)外流式或稱水平層流式。
2．孵育區
本區對無菌的要求雖不比無菌區嚴格，但仍需清潔無塵，因此也應設置在干擾少而非來往穿行的區域。孵育可在孵箱或可控制溫度的溫室中進行，后者費用高，一般實驗室多采用孵箱進行工作。
3．制備區
在該區主要進行培養液及有關培養用的液體等的制備。
4．儲藏區
主要存放各類冰箱、干燥箱、液氮罐、無菌培養液、培養瓶等，此環境也需要清潔無塵。
5．清洗和消毒自凈區
清潔和消毒自凈區應與其他區域分開，主要進行所有細胞培養器皿的清洗、準備、消毒及三蒸水制備等工作。

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